In Berkheide komen 7 soorten amfibieën voor. De meest recente aanwinst is de Boomkikker (sinds 2003 in Berkheide), die door een ‘liefhebber’ is uitgezet in Meijendel en van daar uit in korte tijd het hele duingebied tussen Scheveningen en Katwijk heeft bevolkt. In de voortplantingsperiode concentreren de amfibieën zich in en rond geschikte wateren, de rest van het jaar zijn ze in het hele gebied te vinden.